谷子NBS-LRR类基因家族全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 张宝俊 李任建 李旭凯 申哲源 韩渊怀
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 谷子 NBS-LRR 全基因组 共线性 进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 34-43
• 页数: 10页
• 分类号: S515
• 字数: 4049字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.02.005

摘要

对谷子NBS-LRR类家族成员进行鉴定,并对其染色体分布、基因结构、保守基序、系统进化及表达水平进行分析,为NBS-LRR类家族基因在谷子抗病分子育种中的应用奠定基础.结果 表明,共获得NBS-LRR类家族基因41 1个,其中含CN(CC-NBS)结构的基因376个,含CNL(CC-NBS-LRR)结构的基因33个,含TIR(Toll interleukin-1 receptor)结构的基因1个,仅含NBS结构的基因1个.多数NBS-LRR类家族基因定位在8号染色体.在谷子中NBS结构域存在4段保守序列,且该家族在系统进化中被分为3类,基因结构多样,保守基序Motif1结构最保守.有23个谷子NBS-LRR类基因与狗尾草存在共线性,21个与水稻存在共线性,仅1个与拟南芥存在共线性,其中Seita.8G088500和Seita.8G088400被鉴定为水稻抗稻瘟病的高度同源基因.谷子与水稻、拟南芥的共线性基因的Ka/Ks值均小于1;与狗尾草的共线性基因中,Seita.6G014500、Seita.6G023500的Ka/Ks值均大于1.表达谱分析表明,在谷子根和穗中高表达的NBS-LRR类基因数目较多,叶次之,幼芽中最少,表明该家族基因可能在根及穗抗病过程中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宝俊	山西农业大学农学院	39	256	9.0	15.0
2	韩渊怀	山西农业大学农学院	31	68	4.0	8.0
3	李旭凯	山西农业大学生命科学院	9	2	1.0	1.0
4	李任建	山西农业大学农学院	2	1	1.0	1.0
5	申哲源	山西农业大学农学院	1	0	0.0	0.0