主动脉弓缩窄模型所致小鼠主动脉重塑的lncRNA表达谱分析

• 作者: 修建成 冯婷 周风云 张新禄 张秋霞 路祥麒 陈业佳 陈扬平
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 高血压 动脉重塑 长链非编码RNA 高通量测序技术 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 913-921
• 页数: 9页
• 分类号: R544.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11855/j.issn.0577-7402.2020.09.03

摘要

目的 分析主动脉弓缩窄(TAC)模型所致高压负荷诱导的小鼠主动脉重塑的长链非编码RNA(lncRNA)表达谱并探讨其可能的作用机制.方法 取60只8周龄C57BL/6J雄性小鼠,分别构建TAC模型及进行假手术处理,术后1周TA C模型小鼠右颈总动脉/左颈总动脉血流速度比值为5～10时纳入实验组,假手术处理小鼠该比值为<1者纳入对照组,各24只.分别采用HE、Weigert及天狼猩红染色观察血管中膜厚度、中膜层弹力纤维及胶原纤维沉积情况.应用高通量测序技术鉴定差异表达转录本,并通过生物信息学分析的方法解析动脉重塑后转录本的表达变化.结果 术后1周,实验组的右颈总动脉/左颈总动脉血流速度比值高于对照组,差异有统计学意义(P<0.001).术后2周,与对照组相比,实验组升主动脉内径增大,且发生明显重塑,包括中膜增厚、中膜弹力纤维变稀疏以及大量胶原纤维沉积.根据建立的标准[差异倍数≥2,P<0.05,错误发现率(FDR值)<0.05],实验组与对照组在转录水平上共有199个lncRNA发生显著变化.任意挑选6个lncRNA进行qRT-PCR验证,与测序结果一致.预测lncRNA顺式作用与反式作用的靶基因,GO功能富集及KEGG通路富集分析表明,细胞外基质、细胞基质黏附、核因子(NF)-κB通路及血管平滑肌细胞收缩相关靶基因富集明显.结论 本研究提供了高压负荷所致主动脉重塑中lncRNA表达变化的概况,提示lncRNA参与调节动脉重塑的细胞外基质合成过程,可能有助于阐明高压负荷所致主动脉重塑的潜在分子机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	修建成		37	217	9.0	13.0
2	张秋霞		6	10	3.0	3.0
3	冯婷		1	0	0.0	0.0
4	周风云		1	0	0.0	0.0
5	陈扬平		2	0	0.0	0.0
6	路祥麒		1	0	0.0	0.0
7	陈业佳		1	0	0.0	0.0
8	张新禄		7	35	3.0	5.0