广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析

• 作者: 侯树鉴 刘俊丹 卢智发 唐章生 张宏燕 王大鹏 钟一治 陆专灵 黄小芳
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 克氏原螯虾 遗传多样性 微卫星位点 杂合子缺失 广西
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 水产科学
• 页码范围: 437-444
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.02.025

摘要

[目的]了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据.[方法]选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性.[结果]南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142～3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708～0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899～0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体.5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在.5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898～6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398～0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861～0.8583和0.1528～0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近.UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支.[结论]广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源.