IFN-γ调节间充质干细胞免疫应答的分子机制

• 作者: 王艺静 高文霞 石凯燕 施佳玉 孙毅
• 来源期刊: 同济大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 间充质干细胞 免疫应答 免疫调节 IFN-γ GEO数据库
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 683-690
• 页数: 8页
• 分类号: R392.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16118/j.1008-0392.2020.06.002

摘要

目的 通过基因芯片数据,比较不同浓度的炎症因子IFN-γ预处理对间充质干细胞(mesenchymal stem/stromal cells,MSCs)免疫应答的影响.方法 从GEO数据库下载GSE77814骨髓间充质干细胞经不同浓度的IFN-γ预处理及未处理的基因表达数据,借助GE02R分析差异基因(differentially expressed genes,DEGs).随后对差异基因进行GO富集分析(DAVID数据库)、KEGG通路富集分析(KEGG Mapper/GSEA)、蛋白分析(Uniprot数据库)、并构建差异基因蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI),筛选hub基因.结果 IFN-γ低浓度组与未处理组相比,共筛选出152个差异基因(以下简称IFN-γ-LDEGs),其中133个为上调基因,19个为下调基因.IFN-γ高浓度组与未处理组相比,共筛选出648个差异基因(以下简称IFN-γ-H DEGs),其中431个为上调基因,217个为下调基因.差异基因多与免疫反应、炎症、病毒反应相关.IFN-γ高浓度处理比低浓度处理上调表达更多趋化因子和抑炎因子.IFN-γ-H DEGs同IFN-γ-L DEGs在GO富集分析、KEGG通路富集分析、蛋白分析上的结果接近,但IFN-γ-H DEGs在代谢通路上富集显著.结论 炎症因子IFN-γ对MSCs的转录组具有较大影响,尤其是对免疫应答相关的基因,并且与处理浓度有密切关系.此外,MSCs行使免疫抑制能力可能需要较高浓度的炎症因子授权.