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菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析
菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析
作者:
张治礼
李玉静
王祥和
罗志文
胡福初
范鸿雁
郭利军
阮城城
陈哲
韩冰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
菠萝
TCP基因
基因家族
表达分析
摘要:
[目的]筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考.[方法]以'台农16号'菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRT-PCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况.[结果]共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族.菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件.启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5?AcTCP9均含有乙烯响应元件.表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍.[结论]鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关.
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文献信息
篇名
菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析
来源期刊
果树学报
学科
农学
关键词
菠萝
TCP基因
基因家族
表达分析
年,卷(期)
2020,(11)
所属期刊栏目
种质资源·遗传育种·分子生物学
研究方向
页码范围
1623-1635
页数
13页
分类号
S668.3
字数
语种
中文
DOI
10.13925/j.cnki.gsxb.20200165
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
果树学报
主办单位:
中国农业科学院郑州果树研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9980
CN:
41-1308/S
开本:
大16开
出版地:
河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
邮发代号:
36-93
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
3886
总下载数(次)
6
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