菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析

• 作者: 张治礼 李玉静 王祥和 罗志文 胡福初 范鸿雁 郭利军 阮城城 陈哲 韩冰
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菠萝 TCP基因 基因家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1623-1635
• 页数: 13页
• 分类号: S668.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20200165

摘要

[目的]筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考.[方法]以'台农16号'菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRT-PCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况.[结果]共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族.菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件.启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5?AcTCP9均含有乙烯响应元件.表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍.[结论]鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关.