新型冠状病毒感染致造血损伤及潜在治疗药物的生物信息学分析

• 作者: 卢学春 张皓旻 张钧栋 智鹏 杨波 王毅兴 王紫宁 迟小华 郭斌 陈浩然 陈熙勐
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 造血损伤 药物 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 947-956
• 页数: 10页
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11855/j.issn.0577-7402.2020.09.08

摘要

目的 分析预测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致造血损伤及潜在的治疗药物,为临床救治SARS-CoV-2感染所致造血损伤提供理论依据.方法 利用基因表达数据库(GEO)筛选SARS-CoV-2感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异分析以及基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.通过蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)在线分析网站进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选核心基因.应用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行疾病、药物和关联靶基因分析.结果 共筛选出差异基因222个,其中上调172个,下调50个.GO富集分析结果显示,差异基因主要与Ⅰ型干扰素反应、细胞周期调节、炎性细胞迁移、先天免疫反应、血液微粒和囊泡分泌、趋化因子及其受体等有关.KEGG富集分析结果显示,差异基因主要与病毒感染、心肌损伤、补体及凝血级联、细胞趋化、血小板活化、急性炎症、免疫反应、细胞信号转导等相关信号通路有关.PPI网络分析筛选得到STAT1、IL-6、IRF7、TNF、MX1、ISG15、IFIH1、IRF9、DDX58和GBP1等10个核心基因.EpiMed平台筛选出具有潜在治疗作用的药物包括冬凌草、西罗莫司、糖皮质激素、鱼腥草、何首乌、赤芍、维甲酸、甘草、环孢素A、氟伐他汀等.结论 SARS-CoV-2感染可通过改变一系列基因的表达从而影响造血系统,据此筛选出的潜在治疗药物可为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的基础和临床研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨波		21	113	6.0	10.0
2	王毅兴		9	22	2.0	4.0
3	郭斌		9	27	2.0	5.0
4	智鹏		3	0	0.0	0.0
5	陈浩然		4	13	1.0	3.0
6	陈熙勐		3	0	0.0	0.0
7	迟小华		3	0	0.0	0.0
8	张钧栋		3	0	0.0	0.0
9	张皓旻		3	0	0.0	0.0
10	卢学春		3	0	0.0	0.0
11	王紫宁		1	0	0.0	0.0