女性重度抑郁障碍患者外周血环状RNA的生物信息分析

• 作者: 乔正学 于蕴淼 卜天一 张温馨 杨秀贤 杨艳杰 赵明哲 邱晓惠
• 来源期刊: 中华行为医学与脑科学杂志
• 关键词: 重度抑郁障碍 女性 环状RNA 生物信息分析 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 725-729
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn371468-20200324-01172

摘要

目的 筛选女性重度抑郁障碍患者与健康女性之间呈现差异表达的环状RNA(circRNA),探索可能与抑郁障碍相关的目标circRNA.方法 采用高通量测序筛选3例女性重度抑郁障碍患者差异表达的circRNA,通过|log2FC|≥1,FDR＜ 0.05判定circRNA是否具有表达差异.选择差异程度最大的5个circRNA,根据circRNA的miRNA海绵功能,利用在线数据库预测circRNA可能靶向的miRNA,而后预测miRNA相关靶基因.通过GO生物学过程富集分析和KEGG信号通路富集分析,预测靶基因相关的生物学过程和信号通路.根据高通量测序结果,且具有与抑郁障碍相关的生物学过程及信号通路为依据,筛选与抑郁障碍相关的circRNA.结果 通过差异程度最大的5个circRNA(hsa_circ_ 0020959、hsa_ circ_ 0005959、hsa_circ_ 0033064、hsa_ circ_ 0006862、hsa_circ_ 0027732),预测出13个靶向的miRNA及靶基因,通过靶基因预测出了多个抑郁障碍相关的生物学过程和信号通路,如糖皮质激素受体信号通路、白介素-7的反应、神经系统发育、Wnt信号通路、FoxO信号通路、甲状腺激素信号通路、神经营养素信号通路等.结论 5个circRNA均富集出了与抑郁障碍相关的生物学过程或信号通路,其中hsa_circ_ 0005959、hsa_circ_ 0033064、hsa_circ_ 0006862、hsa_circ_0027732与女性重度抑郁障碍的关联可能更密切.