普通变形杆菌KM-19的培养鉴定及相关机制研究

• 作者: 杨传莲 贾琴妹 黄艳梅
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 普通变形杆菌 迁徙性生长 β溶血 基因组测序
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 52-56
• 页数: 5页
• 分类号: R155.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.012

摘要

目的 分析研究自中段尿培养中分离鉴定出的无迁徙性生长β溶血普通变形杆菌KM-19的生物学特性、耐药机制及基因组特点,为临床合理用药提供指导.方法 常规方法分离培养菌株;采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析仪进行菌种鉴定和体外药物敏感性试验;利用鞭毛染色和半固体动力试验观察鞭毛缺失情况;采用高通量测序技术对该菌全基因组测序,采用生物信息学方法进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘菌株的表型机制及耐药机制相关基因簇信息.结果 VITEK-2Compact鉴定结果为普通变形杆菌.全基因组测序结果显示基因组组装共得48个重叠群,基因总长度3 319 152 bp,平均长度904.89 bp,占基因组全长的85.50％,无重复序列,鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)(G+C)含量为38％.该菌比对到普通变形杆菌可信度最高,也验证了VITEK-2 Compact鉴定结果准确.该菌对一二代头孢菌素、氨苄西林、呋喃妥因、复方新诺明、替加环素耐药,其余均敏感.鞭毛染色油镜下未见鞭毛结构,半固体动力试验阴性;基因组测序序列与VFDB数据库比对结果显示细菌鞭毛基因及相关基因未缺失,但鞭毛基因序列中发现可接受甲基化的趋化性蛋白基因Ⅲ/Ⅰ位点和甲基转移酶基因,还有溶血素基因(hlyB).基因组序列与CARD数据库比对结果显示存在OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因.结论 该株菌无迁徙性生长现象,其主要机制可能是鞭毛基因或相关基因被甲基化,使细菌不能有效表达菌体外鞭毛蛋白,丧失迁徙生长能力;β溶血表型可能由外源性溶血素基因(hlyB)插入细菌基因组中并有效表达.该菌体外耐药情况与OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄艳梅		9	17	3.0	4.0
2	贾琴妹		4	19	1.0	4.0
3	杨传莲		2	0	0.0	0.0