基于microRNA-mRNA相互作用的直肠癌预后标志物的研究

• 作者: 刘佳艺 张明津 杨小丽 贡益敏 邵梦楠 郑盛锋 韦怡
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 直肠癌 GEO数据库 miRNA 关键差异基因 CCND1
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 676-682
• 页数: 7页
• 分类号: R735.34
• 字数: 4227字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2020.04.020

摘要

目的:通过microRNA-mRNA相结合探讨直肠癌潜在的关键差异基因和预后标志物.方法:从基因表达汇编公共数据库(GEO)获取microRNA芯片数据,分析获得差异表达microRNAs(DE-miRNAs)及其靶基因.对差异基因进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,建立差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,鉴定出关键差异基因,再进一步评估关键差异基因的表达水平和预后作用.结果:总共预测了25个上调和14个下调的DE-miRNAs,对DE-miRNAs的靶基因综合分析后获得了共64个差异基因.共鉴定出10个关键差异基因,GEPIA数据库显示有6个关键差异基因在直肠癌中的表达水平显著高于正常直肠黏膜.经PrognoScan数据库验证,细胞周期蛋白cyclin D1 (CCND1)的高表达与结直肠癌较差的预后相关,表达水平和预后的联合分析证明了CCND1的致癌作用.结论:CCND1可能与直肠癌的预后有重要联系,可作为直肠癌预后、药物治疗潜在的新靶点,为后续研究提供新的思路和方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨小丽	广西医科大学医学科学实验中心	23	79	6.0	7.0
3	刘佳艺		3	0	0.0	0.0
4	韦怡		2	0	0.0	0.0
7	邵梦楠	广西医科大学医学科学实验中心	2	0	0.0	0.0
8	郑盛锋		3	0	0.0	0.0
9	贡益敏	广西医科大学医学科学实验中心	1	0	0.0	0.0
10	张明津		1	0	0.0	0.0