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摘要:
旨在对山羊胰岛素受体(insulin receptor,INSR)基因进行可变剪接分析,研究其在背最长肌中的表达模式.本试验以简州大耳羊妊娠期胎儿(妊娠期第45、60和105天)及出生后第3天羔羊背最长肌为试验材料,基于转录组测序数据(accession number:SRR3567144)并利用Sanger测序验证,分析INSR基因的可变剪接体类型及其在背最长肌中的表达差异,同时利用在线软件对不同可变剪接体进行生物信息学分析.结果显示,在山羊背最长肌中INSR基因CDS区存在4种不同的可变剪接形式(INSR1、INSR2、INSR3和INSR4),其CDS长分别为4110、4146、4113和4149 bp,对应的氨基酸残基数分别为1369、1381、1370和1382个.山羊I N S R 4个可变剪接体之间的主要区别在于Exon 11(36 bp)跳跃和Exon 15部分(3 bp)缺失,这两种可变剪接模式在牛、猪、山羊、人、绵羊和小鼠间完全一致.这些可变剪接改变了山羊INSR的Ser磷酸化位点和第二个FN3功能域,使所编码蛋白3D结构在两个区域发生明显改变.同时,各可变剪接体表达量在背最长肌发育的4个时期均无显著性差异(P>0.05),同一时期各可变剪接体表达量之间也无显著性差异(P>0.05).INSR基因序列和剪接模式在哺乳动物中高度保守,该研究结果将为深入揭示I N SR基因对动物肌肉发育的调控机制提供理论参考.
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文献信息
篇名 山羊INSR基因可变剪接体在背最长肌中的表达模式
来源期刊 畜牧兽医学报 学科 农学
关键词 山羊 INSR 可变剪接体 表达模式
年,卷(期) 2020,(8) 所属期刊栏目 遗传育种
研究方向 页码范围 1823-1832
页数 10页 分类号 S827.2
字数 5762字 语种 中文
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.08.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张红平 四川农业大学动物科技学院 74 383 10.0 15.0
2 李利 四川农业大学动物科技学院 53 250 9.0 13.0
3 张潇 四川农业大学动物科技学院 14 95 6.0 9.0
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山羊
INSR
可变剪接体
表达模式
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
月刊
0366-6964
11-1985/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号
82-453
1956
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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