转录组测序分析糖尿病对小鼠AOM/DSS诱导结直肠癌发生的影响

• 作者: 于涛 林志玲 田旷怡 许稷豪 陈其奎 黎洁瑶
• 来源期刊: 新医学
• 关键词: 糖尿病 结直肠癌 小鼠模型 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论著
• 页码范围: 340-347
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-9802.2020.05.004

摘要

目的 探讨糖尿病(DM)对小鼠化学诱导结直肠癌发生的影响.方法 采用氧化偶氮甲烷/葡聚糖硫酸钠诱导db/db小鼠和野生型(WT)小鼠产生结直肠癌,通过Illumina高通量测序技术筛选DM组与非DM组小鼠结肠肿瘤癌旁组织之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释与富集分析.结果 与WT小鼠相比,DM小鼠结直肠的平均肿瘤体积增加(P<0.05).DM小鼠与WT小鼠共有1656个差异表达基因(q<0.05),其中有70个mRNA在整个实验过程中均差异表达,主要组织相容性复合体(MHC)Ⅱ类基因包括H2-Ea-ps、H2-Q1、H2-DMb2、H2-Q4均在DM小鼠中表达上调(q<0.05).GO富集分析发现免疫反应的调控和激活途径、抗原加工与提呈途径、抗原结合是显著富集的类型(q<0.05).KEGG富集分析发现与免疫反应相关的抗原加工与呈递是显著富集的类型(q<0.05).结论 DM状态下,小鼠免疫反应激活,MHCⅡ类基因表达存在显著差异,可能参与促进结直肠癌的发生发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于涛	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	30	132	5.0	10.0
2	陈其奎	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	70	498	12.0	19.0
3	黎洁瑶	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	5	4	1.0	2.0
4	许稷豪	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	7	16	3.0	4.0
5	田旷怡	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	2	3	1.0	1.0
6	林志玲	中山大学孙逸仙纪念医院消化内科	1	0	0.0	0.0