空肠弯曲菌脂寡糖核心区合成相关基因簇遗传多样性研究

• 作者: 周贵兰 张建中 张茂俊 梁昊 王佳奇 顾一心
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 空肠弯曲菌 脂寡糖 遗传多态性 基因分型
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 食源性弯曲菌监测专题
• 页码范围: 10-15
• 页数: 6页
• 分类号: R378
• 字数: 3722字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.01.005

摘要

目的 分析我国空肠弯曲菌脂寡糖(LOS)核心区合成相关基因簇的序列特征,获得LOS核心区合成相关基因簇的特异DNA序列特征.方法 选择132株空肠弯曲菌的全基因组序列,采用OrthoMCL软件,进行LOS核心区合成相关基因簇DNA的同源性分析并以特异型别基因簇的特异序列为靶位点,建立PCR方法,根据特异引物序列以及扩增产物大小,识别菌株LOS核心区合成相关基因簇的主要型别.结果 在132株菌中,105株菌的LOS核心区合成相关基因簇的DNA序列属于14个已确定的LOS型别,27株菌为新型LOS,根据DNA的同源性可分为10个新型别,分别命名为CDC1～10.LOS合成相关基因序列中存在大量的多聚A/T、多聚G/C结构以及碱基的插入、缺失等突变,部分突变有可能导致LOS相关合成酶及转移酶的氨基酸序列发生改变,影响其抗原性.针对A、B、C、CDC8型LOS的特异DNA序列建立的PCR鉴定方法可在50株测序菌株的基因组中得到验证.结论 10种LOS新型别的发现有利于更准确地鉴定空肠弯曲菌,解释LOS的抗原多样性特征.空肠弯曲菌的LOS核心区合成相关基因簇序列多样丰富,存在大量多聚结构和DNA序列的突变,是潜在的导致LOS抗原多样性的原因.主要LOS分型的PCR法可用于陕速筛查5种特异LOS型,但仍需要更多菌株的验证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建中	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	140	649	13.0	18.0
2	顾一心	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	9	14	2.0	3.0
3	张茂俊	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	19	73	4.0	8.0
4	王佳奇	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	24	151	8.0	11.0
8	梁昊	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	3	0	0.0	0.0
9	周贵兰	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	3	0	0.0	0.0