辣椒β-酮脂酰辅酶A合酶基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 张志硕 易婷 汤冰倩 谢玲玲 邹学校
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 KCS基因家族 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 370-380
• 页数: 11页
• 分类号: S641.3
• 字数: 6077字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0574

摘要

为深入了解β-酮脂酰辅酶A合酶(β-ketoacyl-CoA synthase,KCS)基因家族在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定所有KCS基因家族成员,对基因染色体定位、系统发育关系、基因结构、蛋白保守基序和组织表达模式等进行分析,并通过qRT-PCR方法检测基因在高温、低温和NaCl胁迫下的响应.从辣椒基因组中共鉴定出22个KCS家族基因,其不均匀地分布在辣椒的9条染色体上;系统发育分析表明辣椒KCS基因家族可分为4组,每组含有不同数量的基因;该家族成员含有0～3个内含子,保守基序有6～14个;KCS家族基因具有不同的表达模式;高温、低温和NaCl处理可以抑制或激活该家族成员的表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹学校		14	108	4.0	10.0
3	易婷		10	42	3.0	6.0
4	谢玲玲		8	9	1.0	3.0
5	汤冰倩		4	1	1.0	1.0
8	张志硕		1	0	0.0	0.0