黄喉拟水龟性别调控相关lncRNA和mRNA的筛选及初步分析

• 作者: 刘晓莉 徐红艳 朱彦雨 朱新平 李伟 洪孝友 王亚坤
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄喉拟水龟 转录组 长链非编码RNA 性别决定 性别分化
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 页码范围: 1960-1975
• 页数: 16页
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20200312187

摘要

性别异形在动物界广泛存在,长期以来一直是生物学中的热门话题.黄喉拟水龟性别分化属温度依赖型,其温度响应分子机制仍不清楚.为了进一步解析龟鳖动物性别分化的分子机制,本研究初步比较分析了黄喉拟水龟转录本中性别差异表达(different expressed,DE)的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)及其调控的靶基因.首先,运用Illumina深度测序平台,通过转录组测序(RNA-Seqs)对黄喉拟水龟的精巢和卵巢进行了比较转录组学分析并筛选鉴定出雌雄差异转录本,共筛选获得8237个DE mRNA和9573个DE lncRNA.通过GO功能注释及KEGG通路富集分析发现,上述差异转录本主要参与龟鳖动物性别分化和性腺发育等相关信号通路.此外,通过顺式和反式作用分析,筛选获得了一系列与生殖发育相关的(性腺发育和性别分化)受DE lncRNAs调控的靶基因.本研究为进一步阐明黄喉拟水龟温度依赖型性别的分子机制提供了线索,特别是为进一步挖掘利用龟鳖动物性别决定因子,进行龟鳖动物性控育种技术研究奠定了基础.