狼疮性肾炎相关基因的共表达网络构建与分析

• 作者: 唐志明 杜秀日 林栩 梁钊 王晨 覃卿 韦美理
• 来源期刊: 右江医学
• 学科: 医学
• 关键词: 狼疮性肾炎 生物信息学 基因 共表达网络
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 论著·基础研究
• 页码范围: 407-414
• 页数: 8页
• 分类号: R593.24+2
• 字数: 5054字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1383.2020.06.002

摘要

目的 基于基因表达综合数据库(GEO)挖掘与狼疮性肾炎(LN)相关的潜在基因.方法 从GEO中搜集LN相关的样本,获得GSE32591、GSE81622、GSE99967共3个数据集.利用GEO2R平台对这3个数据集进行分析,筛选出共同差异基因,并利用在线分析工具DAVID完成GO富集分析和KEGG通路富集分析.将筛选出的共同差异基因导入STRING在线数据库,构建共同差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络,利用Cytoscape软件进行模块分析并识别枢纽基因.结果 筛选得到110个共同差异基因.GO富集分析发现这些基因主要参与了防御反应、免疫反应、对病毒的反应、对细菌的反应、对伤害的反应、炎症反应等生物学过程.KEGG通路富集分析主要包括了系统性红斑狼疮、抗原处理和呈递、补体与凝血级联、RIG-I样受体等信号通路.从最显著基因模块中识别出10个枢纽基因:RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IFIT3.结论 生物信息学分析显示RSAD2、OAS1、MX1、ISG15、DDX58、IFIH1、IFI44、IFI44L、IFIT1、IFIT3可能是与LN相关的枢纽基因,为LN的机制研究提供了一种全新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林栩	右江民族医学院附属医院肾内科	104	325	9.0	12.0
2	覃卿	右江民族医学院研究生学院	6	13	2.0	3.0
3	韦美理	右江民族医学院研究生学院	6	8	2.0	2.0
4	梁钊	右江民族医学院附属医院肾内科	4	0	0.0	0.0
8	杜秀日	右江民族医学院研究生学院	4	0	0.0	0.0
9	唐志明	右江民族医学院研究生学院	1	0	0.0	0.0
10	王晨	右江民族医学院研究生学院	1	0	0.0	0.0