滇陆猪Nramp1基因多态性对其在组织中表达的影响

• 作者: 刘韶娜 张斌 张桂生 沙茜 相德才 赵彦光 赵智勇 韩敏
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 滇陆猪 自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1) 多态性位点(SNPs) 基因型 组织差异表达
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 202-208
• 页数: 7页
• 分类号: S828.89
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.01.026

摘要

[目的]明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1基因(Nramp1)多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响,从分子遗传学角度阐述滇陆猪不同基因型个体对疫病免疫的遗传差异,为其抗病育种选育提供参考依据.[方法]采用PCR对27头滇陆猪Nramp1基因进行扩增,以DNASTAR 5.0进行序列比对分析及多态性(SNP)位点检测;同时利用实时荧光定量PCR检测Nramp1基因在滇陆猪各组织中的相对表达量,并运用SPSS 19.0分析Nramp1基因多态性对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响.[结果]在滇陆猪Nramp1基因第5外显子、第5内含子和第6外显子上分别发现SNP1(T→C)、SNP2(A→G)和SNP3(G→A)等3个SNPs位点,都只存在2种基因型,且SNP1位点和SNP3位点在试验猪群体中属于低度多态[多态信息含量(PIC)/杂合度(He)<0.25)],SNP2位点属于中度多态(0.25<PIC/He<0.5).Nramp1基因在滇陆猪各组织间的相对表达量均存在显著差异(P<0.05,下同),具体表现为肺脏>肝脏>脾脏>心脏;此外,Nramp1基因在不同基因型滇陆猪群体中表现出的组织差异表达也不同,尤其是Nramp1基因在SNP2位点纯合群体肝脏中的相对表达量显著低于在杂合群体肝脏中的相对表达量,说明Nramp1基因多态性变异对其在滇陆猪组织中的表达有显著影响.[结论]Nramp1基因SNP位点变异能影响Nramp1基因在滇陆猪各组织中的表达变化,从而影响机体的免疫应答反应,其中SNP2位点可作为滇陆猪抗病育种的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵彦光		46	163	7.0	11.0
2	赵智勇		52	102	5.0	7.0
3	刘韶娜		14	27	4.0	5.0
4	沙茜		13	22	3.0	4.0
5	相德才		13	15	2.0	3.0
6	张斌		9	7	2.0	2.0
7	韩敏		5	1	1.0	1.0
8	张桂生		1	0	0.0	0.0