基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
[目的]通过生物信息学分析明确磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine-binding proteins,PEBP)家族在桃基因组中的分布、结构及进化特征,并解析桃PEBP蛋白家族成员Pp TFL1基因功能,为后续利用分子手段调控桃开花时间提供理论依据.[方法]以拟南芥6个PEBP蛋白的氨基酸序列为参考序列,检索桃基因组中的PEBP基因家族成员,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测Pp TFL1基因在桃不同组织中的表达量,构建Pp TFL1过表达载体转化拟南芥.[结果]从桃全基因组鉴定出5个PEBP蛋白家族基因,均由4个外显子和3个内含子组成.5个桃PEBP蛋白中都包含PEBP保守基序和决定FT/TFL1功能的关键氨基酸位点;桃PEBP蛋白基因家族可分为TFL1-like、MFT-like和FT-like三个亚族.克隆获得PpTFL1基因编码序列(CDS),片段大小为519 bp;qRT-PCR结果表明,PpTFL1在'中油桃14号'茎尖的表达量最高;与野生型相比,5个转Pp TFL1的转基因拟南芥阳性株系均表现花期推迟;PpTFL1在5个转基因植株中均有表达,但不同单株间表达量有差异.[结论]PpTFL1基因过表达导致拟南芥花期推迟,表明PpTFL1基因参与花期调控.
推荐文章
谷子FT/TFL1家族的全基因组鉴定与分析
谷子
FT基因家族
生物信息学
龙眼TFL1基因的克隆与表达
龙眼
TFL1同源基因
基因克隆
基因表达
茶树PPR基因家族全基因组鉴定及白化相关基因表达分析
茶树
PPR基因家族
转录组
生物信息学
实时荧光定量PCR
亚洲棉和雷蒙德氏棉PEBP家族基因的鉴定及该家族基因在陆地棉组织中表达分析
磷脂酰乙醇胺结合蛋白
亚洲棉
雷蒙德氏棉
成花素
基因表达
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 桃PEBP基因家族全基因组鉴定及桃TFL1基因功能分析
来源期刊 果树学报 学科 农学
关键词 PEBP基因家族 TFL1 基因功能 开花时间
年,卷(期) 2020,(10) 所属期刊栏目 种质资源·遗传育种·分子生物学
研究方向 页码范围 1443-1454
页数 12页 分类号 S662.1
字数 语种 中文
DOI 10.13925/j.cnki.gsxb.20200322
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 冯建灿 104 1937 19.0 42.0
2 王伟 21 99 7.0 9.0
3 郑先波 79 409 9.0 17.0
4 谭彬 36 67 5.0 6.0
5 魏鹏程 8 8 2.0 2.0
6 连晓东 5 2 1.0 1.0
7 程钧 5 0 0.0 0.0
8 陈谭星 2 0 0.0 0.0
9 栗焕楠 2 0 0.0 0.0
10 王小贝 2 0 0.0 0.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (296)
共引文献  (21)
参考文献  (29)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1972(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1973(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1981(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1990(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1991(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1992(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1995(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
1996(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
1997(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
1998(6)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(5)
1999(11)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(9)
2000(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2001(7)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(7)
2002(7)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(7)
2003(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
2004(11)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(10)
2005(23)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(22)
2006(12)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(11)
2007(24)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(21)
2008(17)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(16)
2009(17)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(16)
2010(33)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(32)
2011(30)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(29)
2012(33)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(31)
2013(29)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(25)
2014(23)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(22)
2015(10)
  • 参考文献(5)
  • 二级参考文献(5)
2016(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
2017(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2018(3)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(2)
2019(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2020(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
PEBP基因家族
TFL1
基因功能
开花时间
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
果树学报
月刊
1009-9980
41-1308/S
大16开
河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
36-93
1984
chi
出版文献量(篇)
3886
总下载数(次)
6
总被引数(次)
85940
论文1v1指导