干旱胁迫下两个玉米自交系雄穗花器官分化期的转录组分析

• 作者: 刘俊 李铭东 杨杰 梁晓玲 王业建 郗浩江 阿布来提·阿布拉 韩登旭
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 干旱胁迫 转录组 差异基因
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1578-1585
• 页数: 8页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2020.09.002

摘要

[目的]运用现代分子生物学及高通量测序技术,在全基因组水平鉴定耐旱相关的基因,研究玉米雄穗花器官分化期对干旱胁迫的响应机理,为抗旱育种将提供新的理论基础.[方法]以干旱胁迫15 d和正常浇水的耐旱自交系"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"花器官分化期的雄穗进行Illumina HiSeq 2000高通量测序分析,将测序得到的Unigene与玉米参考基因组进行比对,利用RPKM来衡量样本间的基因表达丰度,以|log2 fold-change|≥1,P<0.05,FDR≤0.001筛选出样本间的差异表达基因,并通过Gene Onto 1ogy(GO)数据库、KEGG pathway数据库对筛选出的差异表达基因的功能和参与的调控路径进行分析.[结果]与正常水分处理相比,耐旱自交"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"在干旱胁迫下分别有1394个和1300个显著差异表达基因,其中共有差异表达基因831个,包括上下调表达趋势是一致的822个基因和9个具有相反的表达模式基因.除这些基因外,各自分别还有563个和469个基因型特异的干旱响应基因,这些特异的干旱响应基因的G0富集分析的条目并不完全相同,除共同富集在刺激响应,细胞壁改变外,耐旱自交"PHBA6"还富集在激素合成调控,机氮化合物代谢、蛋白结合上,特异的干旱响应基因的KEGG显著性富集分析在2个自交系中也不完全相同,耐旱自交"PHBA6"还有部分差异基因富集在生物素代谢通路上,另外,筛选出耐旱自交"PHBA6"中在干旱胁迫下差异表达的3个脱水素基因和3个特有差异表达的bZIP、MYB和ERF转录因子.[结论]胁迫相关基因的特异性响应可能是材料间耐旱性存在差异的主要原因,耐旱自交"PHBA6"中的3个脱水素基因和3个特有差异表达的bZIP、MYB和ERF转录因子基因在玉米耐旱育种中可能有重要的利用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁晓玲		35	388	9.0	19.0
2	李铭东		26	295	8.0	17.0
3	刘俊		10	28	3.0	4.0
4	阿布来提·阿布拉		24	80	6.0	8.0
5	韩登旭		23	70	6.0	7.0
6	杨杰		20	61	5.0	7.0
7	王业建		5	0	0.0	0.0
8	郗浩江		6	3	1.0	1.0