基于线粒体基因组的东方鲀属系统发育学及群体遗传学

• 作者: 刘波 周志雄 宫杰 徐鹏 白玉麟 阳俊逸
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 东方鲀 线粒体基因组 单核苷酸多态性标记 系统发育 Ka/Ks
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 页码范围: 1792-1803
• 页数: 12页
• 分类号: Q347|S931.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20191212107

摘要

为了探究东方鲀属内系统发育关系,本研究首次基于群体尺度对东方鲀属物种进行系统发育分析.利用线粒体基因组,在包含10个种的124尾东方鲀中,挖掘了1488个单核苷酸多态性(SNP)位点和4个插入缺失(INDEL),使用这些遗传变异位点进行了系统发育及群体遗传学分析.发现网纹东方鲀与铅点东方鲀可能是同种异名,且二者形成的姊妹群位于东方鲀属基部;暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、菊黄东方鲀与双斑东方鲀各自亲缘关系较近.此外,实验发现了4尾可疑的双斑东方鲀和菊黄东方鲀杂交个体,以及2尾可疑的横纹东方鲀杂交个体.遗传多样性方面,弓斑东方鲀遗传多样性最低.此外,实验在10种东方鲀中共找到595个种间特异性SNP位点.Ka/Ks分析表明,nd6基因的Ka/Ks最高(平均为1.19),说明在东方鲀属中nd6可能经历了正选择,而ATP合成酶基因可能在东方鲀适应淡水环境中受到选择.研究表明,东方鲀属内系统发育关系较为复杂,且在野生环境下东方鲀物种间广泛存在自然杂交现象,该研究为东方鲀物种快速鉴定提供可靠的分子标记,加速东方鲀属系统发育研究进展,并为东方鲀野生种质资源保护提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘波		27	89	5.0	7.0
2	周志雄		1	0	0.0	0.0
3	宫杰		1	0	0.0	0.0
4	白玉麟		1	0	0.0	0.0
5	阳俊逸		1	0	0.0	0.0
6	徐鹏		1	0	0.0	0.0