青藏高原藏原羚携带海氏肠球菌的特征研究

• 作者: 周娟 徐建国 杨晶 董魁 蒙家嘉
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 海氏肠球菌 藏原羚 荚膜多糖基因簇 耐药性 基因组分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 231-236
• 页数: 6页
• 分类号: R446.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2020.03.012

摘要

目的 研究青藏高原野生动物藏原羚携带的海氏肠球菌特征.方法 分离细菌,采用168 rRNA、rpoA基因序列比对方法鉴定藏原羚携带的海氏肠球菌.采用K-B纸片法进行药敏试验;使用COGs、SwissProt、CARD和VFDB等数据库对基因组进行分析;采用MUMmer和TreeBest软件构建单核苷酸多态性系统进化树图.结果 从15份藏原羚粪便样品分离到2株海氏肠球菌.生化分析、16S rRNA和rpoA基因序列分析支持其为海氏肠球菌的鉴定.基因组分析发现其携带荚膜多糖基因簇.系统进化树分析提示2株藏原羚源海氏肠球菌分别属于不同的进化分支,且都与动物源性菌株进化关系更近.2株菌对多种常用抗生素敏感.结论 青藏高原藏原羚携带的病原菌海氏肠球菌基因组中存在荚膜多糖基因簇,利于其抵抗不利环境因素,提示YL69可能具备在人群中传播的潜力.