基于高通量测序分析晚期肺癌患者肺部微生物多样性

• 作者: 冉卓楠 刘洁星 王芬 信彩岩 沈湘 曾山 宋章永 熊彬
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 关键词: 肺肿瘤 基因组学 生物多样性 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 1031-1038
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2020.103.16

摘要

背景 与目的肺部微生物组与肺部疾病的发生密切相关,微生物可从多方面促进肿瘤的发生与发展.既往研究证实肺癌患者肺部微生物组较健康人发生了变化,但关于不同类型肺癌患者中肺部微生物组的微生物组成尚未明确.本研究旨在探讨不同组织学类型肺癌间的微生物组相关性及差异性.方法 采用Illumina HiSeq高通量测序技术对晚期肺癌患者痰样本进行细菌V3-V4区的16S rDNA测序及生物信息学分析.结果 经物种分类分析发现肺癌患者痰样本中以链球菌属、奈瑟氏菌属、普雷沃氏菌属为主.腺癌(adenocarcinoma,AD)组以链球菌属及奈瑟氏菌属为主,小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)组以奈瑟氏菌属为主,鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)组以链球菌属为主,混合型小细胞肺癌(combined small cell lung cancer,C-SCLC)组以链球菌属为主.结论 不同组织学类型肺癌的肺部细菌微生物组结构及组成存在差异性,不同组织学类型肺癌间优势菌群有所不同,本研究丰富了肺癌肺部细菌微生物组学数据.