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闽江河口湿地植物根际土壤氨氧化细菌群落结构分析
闽江河口湿地植物根际土壤氨氧化细菌群落结构分析
作者:
陈丽华
吕新
刘兰英
黄薇
李玥仁
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
闽江河口湿地
氨氧化细菌
amoA基因
群落结构
高通量测序技术
摘要:
[目的]研究闽江河口湿地不同植物根际土壤中氨氧化细菌群落多样性及结构组成,为阐明湿地植物根际土壤脱氮功能微生物类群研究提供科学数据.[方法]多点混合采样法采集不同季节不同土层闽江河口湿地芦苇、互花米草和红树林根际的土壤样品共24个,通过高通量测序技术测定样品氨单加氧酶编码基因amoA序列,生物信息学方法分析土壤样品氨氧化细菌的群落结构及多样性.[结果]24个样品中共检测到300527条有效序列,2794个OTU.多样性分析结果表明,芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数差别不大,Shannon指数平均值表现为红树林>芦苇>互花米草;芦苇和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均表现为春季最低;不同土层芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均未呈现出明显的变化趋势.群落结构分析结果表明,闽江河口湿地土壤样品中存在着较多分类地位未确定的氨氧化细菌,而分类地位确定的氨氧化细菌中,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势菌属包括亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)、硫杆菌属(Thiobacillus)、Caldimonas属等.[结论]闽江河口湿地植物根际土壤中氨氧化细菌的主要优势菌群大多是亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),硫杆菌属(Thiobacillus)和Caldimonas属为个别样品的优势菌群.
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细菌
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群落结构
内容分析
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文献信息
篇名
闽江河口湿地植物根际土壤氨氧化细菌群落结构分析
来源期刊
福建农业学报
学科
生物学
关键词
闽江河口湿地
氨氧化细菌
amoA基因
群落结构
高通量测序技术
年,卷(期)
2020,(12)
所属期刊栏目
资源与环境科学
研究方向
页码范围
1368-1375
页数
8页
分类号
Q938
字数
语种
中文
DOI
10.19303/j.issn.1008-0384.2020.12.010
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
福建农业学报
主办单位:
福建省农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1008-0384
CN:
35-1195/S
开本:
大16开
出版地:
福建省福州市五四路247号省农科院大楼
邮发代号:
34-56
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
3518
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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