黑木耳实时荧光定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 姚方杰 孙文娟 张越 方明 武春爽
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 候选内参基因 核糖核酸 互补DNA 不同菌株 不同生育期
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1510-1519
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.200048

摘要

黑木耳Auricularia heimuer是我国主要栽培的食用菌之一,具有较高的经济价值和生态价值.本研究以黑木耳不同菌株(A14、A137和A12)和不同生育期的样品(菌丝体、原基和子实体)为实验材料,提取RNA,反转录成cDNA,在全基因组注释结果的基础上,选择12个候选内参基因(APRTase、β-TUB、RPL2、EF-1a、EF-2、PGI、PGM、H+-ATPase、Tspd、TUB-1a、18S rRNA和28S rRNA)并设计跨内含子的引物,采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术进行扩增,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和ACt算法以及综合评价软件RefFinder,筛选适宜的内参基因.结果 表明18S rRNA、β-TUB、EF1-a和28SrRNA适宜作为不同菌株的内参基因,APRTase、18S rRNA和28S rRNA适宜作为不同生育期的内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚方杰	吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心	86	752	13.0	24.0
5	方明	吉林农业大学园艺学院	21	107	6.0	9.0
6	张越	吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心	13	84	5.0	9.0
10	孙文娟	吉林农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0
11	武春爽	吉林农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0