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铁皮石斛亲环蛋白基因DoCyP的克隆及表达分析
铁皮石斛亲环蛋白基因DoCyP的克隆及表达分析
作者:
乔洁
付亚娟
侯晓强
李文静
王晶
陈霞婷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
铁皮石斛
亲环蛋白
DoCyP
qRT-PCR
低温胁迫
摘要:
采用RT-PCR技术克隆了铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)亲环蛋白基因(DoCyP),其大小为522 bp,编码173个氨基酸.生物信息学预测,DoCyP相对分子质量18.25kD,理论等电点8.72,含肽脯氨酰顺反异构酶保守结构域,无跨膜结构域,是稳定的亲水性蛋白质.SOPMA预测DoCyP的二级结构主要由无规卷曲和延伸链构成.系统进化树揭示铁皮石斛DoCyP与深圳拟兰CyP聚为一支,亲缘关系较近.qRT-PCR分析表明,DoCyP在铁皮石斛组织中为组成型表达,在根中表达量最高,叶和茎中表达量较低.4℃胁迫12 h,DoCyP在铁皮石斛根和茎中表现为上调表达,在叶中下调表达.推测DoCyP参与铁皮石斛对低温胁迫的应答.
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基因
综述
铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析
铁皮石斛
热激转录因子(Hsf)
基因家族
系统发育进化树
胁迫
顺式作用元件
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
铁皮石斛亲环蛋白基因DoCyP的克隆及表达分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
铁皮石斛
亲环蛋白
DoCyP
qRT-PCR
低温胁迫
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
581-589
页数
9页
分类号
S567
字数
语种
中文
DOI
10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0357
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
付亚娟
廊坊师范学院生命科学学院
14
13
2.0
3.0
3
乔洁
廊坊师范学院生命科学学院
29
50
5.0
6.0
5
李文静
廊坊师范学院生命科学学院
8
3
1.0
1.0
6
王晶
廊坊师范学院生命科学学院
12
18
3.0
4.0
14
陈霞婷
廊坊师范学院生命科学学院
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引证文献
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同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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节点文献
铁皮石斛
亲环蛋白
DoCyP
qRT-PCR
低温胁迫
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
园艺学报
主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
总下载数(次)
13
总被引数(次)
123287
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