3种DNA分子标记法联合鉴别草珊瑚及其混伪品

• 作者: 吴耀生 朱丹 罗育 蔡丹昭 郭宏伟 黄春喜
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 草珊瑚 混伪品 18 S rRNA基因 ITS2序列 SCAR标记 鉴别
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 733-740
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.03.025

摘要

目的 采用18 S rRNA基因、ITS2序列、SCAR标记等3种DNA分子标记法鉴别草珊瑚,为其分子鉴定提供依据.方法 通过PCR扩增、克隆测序后获得草珊瑚18 S rRNA基因序列,并进行Blast比对;通过PCR扩增、测序并注释后获得草珊瑚ITS2序列,从GenBank上收集混伪品和其他植物的ITS2序列,使用MEGA 5.5软件,计算种内种间遗传距离,构建系统聚类树;通过RAPD法获得草珊瑚SCAR分子标记,克隆测序后,设计特异性引物扩增草珊瑚及其混伪品.结果 获得的草珊瑚18 S rRNA基因长度为1 820bp,Blast比对显示草珊瑚与金粟兰科同源性最高,同源性为99％,证明其为草珊瑚的18 S rRNA基因.获得的草珊瑚ITS2序列长度为500 bp,草珊瑚与其混伪品之间的遗传距离为0.190～0.219,混伪品之间的遗传距离为0～0.074,聚类分析显示草珊瑚聚为一支,混伪品聚为一支,与其他植物距离较远.获得草珊瑚的SCAR分子标记,用特异性引物扩增出现草珊瑚特异性产物,混伪品未出现特异性产物.结论 3种分子标记法联合可更有效地鉴别草珊瑚及其混伪品,从而建立一套新的鉴别草珊瑚与混伪品的方法,为其鉴别提供新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴耀生	广西医科大学基础医学院	51	409	11.0	17.0
2	朱丹	广西医科大学药学院	54	390	10.0	17.0
3	蔡丹昭	广西医科大学基础医学院	20	139	8.0	11.0
4	罗育	广西医科大学基础医学院	18	95	5.0	9.0
5	郭宏伟	广西医科大学药学院	14	46	4.0	6.0
6	黄春喜	广西医科大学第一附属医院药学部	9	91	6.0	9.0