2016-2018年吉林省猪圆环病毒2型流行病学调查及序列分析

• 作者: 刘东旭 尹柏双 苗丽娟
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 猪圆环病毒2型 流行 全基因组序列 遗传进化
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 33-36,40
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+2
• 语种: 中文

摘要

为了调查吉林省猪圆环病毒2型(PCV2)的流行情况,对2016-2018年采集的434份疑似PCV2感染病料或血清样品进行PCR检测,并对其中分离的2株PCV2 (2017/2018)进行全基因组的扩增、测序及遗传进化分析.PCR检测结果显示,PCV2的阳性率为38.5％.基因测序结果显示,PCV2-2017和PCV2-2018全基因组长度为1 767 bp.全基因同源性分析显示,PCV2-2017与法国株AF055394同源性最高,可达99.8％,与PCV2-2018同源性最低,为80.1％;PCV2-2018与法国株AY322001同源性最高达99.8％,与上海株GU124593同源性最低,为77.2％.遗传进化分析结果显示,与国内外参考毒株比较,PCV2-2017和PCV2-2018处于2个不同的分支中,其中1个分支中PCV2-2018与国内GU370064、AY691169、AY969004、DQ180393及国外AY322001、AB426905毒株亲缘关系较近;PCV2-2017与HM102350、JQ809464、GU124593、AF055394、AF055391、GU325757、JX512856组成第2个分支,与法国株AF055394亲缘关系最近,同属于PCV-2b亚型,与JQ809464、HM102350、GU124593亲缘关系也较近.本试验将为后续PCV2的诊断防控及病毒学研究提供参考依据.