基于数据挖掘分析软组织肉瘤中PRC1的表达与意义及其对肉瘤细胞生长的影响

• 作者: 李徐奇 王文娟 王曙逢 田涛 蒋正东
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 细胞分裂蛋白调节因子1 软组织肉瘤 脂肪肉瘤 数据挖掘 细胞增殖
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 859-866
• 页数: 8页
• 分类号: R738.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb202006010

摘要

目的 通过数据库挖掘,深入探讨细胞分裂蛋白调节因子1(PRC1)在软组织肉瘤(STS)中的表达及意义,以及沉默PRC1对脂肪肉瘤(LPS)细胞增殖和周期的影响.方法 Oncomine数据库提取PRC1在STS组织和癌旁正常组织中的表达数据,随后以TCGA数据库加以验证;OncoLnc数据库提取PRC1的预后信息,分析PRC1表达水平与STS患者预后的关系;CCLE数据库提取PRC1在STS细胞中的表达数据;String网站获取PRC1的共表达分子并绘制PRC1的共表达网络.Western blotting和Real-time PCR检测LPS细胞株SW872及人皮下前脂肪细胞株HPA-s中PRC1的表达;应用siRNA构建沉默PRC1的SW872细胞(SW872-siPRC1),MTT和流式细胞术分别检测沉默PRC1后对SW872增殖及细胞周期的影响.结果 Oncomine数据库中共11项研究涉及STS组织和癌旁正常组织中PRC1的表达,PRC1在STS中高表达(P＜0.05).TCGA数据库的验证结果与Oncomine数据库挖掘结果一致.OncoLnc数据库的预后分析结果显示,高表达PRC1的STS患者总体生存率较差(P＜0.05).CCLE数据库的结果提示,PRC1在STS细胞中呈普遍高表达(P＜0.05).String网站绘制PRC1的共表达网络,包括11个节点和55个连接.PRC1在LPS细胞SW872中呈高表达,细胞增殖曲线显示,沉默PRC1的SW872-siPRC1细胞培养48、72h,较癌旁对照组SW872-NC细胞增殖明显降低,差异具有统计学意义(P＜0.05).与SW872-NC细胞比较,SW872-siPRC1组细胞G1期的细胞比例明显下降[(40.27±7.42)％vs.(62.01±4.89)％];G2/M期的细胞比例明显上升[(25.65±1.54)％ vs.(8.17±0.96)％],差异均有统计学意义(均P＜0.05).结论 PRC1在STS组织和细胞中呈现高表达,与STS预后相关;沉默PRC1基因抑制LPS SW872细胞增殖,阻滞细胞于G2/M期,可能为STS特别是LPS的临床治疗和预后研究提供潜在靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王曙逢	西安交通大学第一附属医院	42	196	9.0	12.0
2	李徐奇	西安交通大学第一附属医院	23	65	5.0	6.0
3	田涛	西安交通大学第一附属医院	31	134	5.0	10.0
4	王文娟	西安交通大学第一附属医院	23	44	4.0	5.0
5	蒋正东	西安交通大学第一附属医院	2	4	1.0	2.0