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肾缺血-再灌注损伤circRNA表达的变化及对Hippo信号途径的影响
肾缺血-再灌注损伤circRNA表达的变化及对Hippo信号途径的影响
作者:
刘芬
娄远蕾
张恒
李勇
杨阳
罗丹
邓君
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
环状RNA
Hippo通路
YAP
肾缺血-再灌注损伤
RNA测序
GO分析
KEGG分析
Cpeb3
摘要:
目的 分析小鼠肾缺血-再灌注损伤环状RNA(circRNA)及Hippo信号分子YAP的表达变化,初步探讨circRNA对肾缺血-再灌注损伤的作用.方法 构建小鼠肾缺血-再灌注损伤模型,检测血清肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)及肾组织病理改变判断模型成功.应用Illumina HiSeq2500系统进行高通量双端测序建立显著差异表达circRNA表达谱.实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证测序结果及检测相关基因.采用基因功能(GO)分析、通路(KEGG)分析等方法探讨差异表达circRNA参与肾IR损伤的生物功能及作用的主要信号通路.采用蛋白印迹实验检测主要信号分子的表达情况.结果 缺血组和对照组间差异显著的circRNA 21个(P<0.05,FC>2),其中10个表达上调,11个表达下调.随机(随机数字法)选取circRNA.1100和cⅡrcRNA.1122进行验证,结果显示肾IR 1d二者的相对表达倍数分别为(0.23±0.016)和(0.36±0.12),相比于对照组均显著降低(P<0.05),与测序数据趋势一致.circRNA.1100在IR2d和3d的肾组织中表达依然显著下调,相对表达倍数分别为(0.24±0.08)和(0.34±0.03)(P<0.05).circRNA.11 00母基因Cpeb3在肾IR1d、2d及3d的相对表达倍数分别为(0.047±0.022)、(0.098±0.027)和(0.185±0.055),与对照组比较显著下调.生物学功能和通路分析显示差异表达circRNA显著富集在细胞周期、分裂、生长、凋亡、死亡等生物过程及Hippo信号通路.肾IR1d后Hippo通路效应分子YAP蛋白明显上调,持续至IR第3天.结论 circRNA参与了肾IR损伤的生理病理过程,差异表达的circRNA及Hippo信号通路可能在肾IR损伤的发生发展中起关键作用.
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篇名
肾缺血-再灌注损伤circRNA表达的变化及对Hippo信号途径的影响
来源期刊
中华急诊医学杂志
学科
关键词
环状RNA
Hippo通路
YAP
肾缺血-再灌注损伤
RNA测序
GO分析
KEGG分析
Cpeb3
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
1066-1071
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2020.08.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李勇
南昌大学第一附属医院肿瘤科
148
503
10.0
14.0
2
娄远蕾
南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所
47
114
7.0
8.0
3
刘芬
南昌大学第一附属医院重症医学科
61
327
11.0
14.0
4
邓君
南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所
16
24
3.0
4.0
5
罗丹
南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所
32
107
6.0
9.0
6
杨阳
南昌大学附属口腔医院检验科
28
56
4.0
6.0
7
张恒
南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所
1
0
0.0
0.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(52)
共引文献
(13)
参考文献
(21)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1900(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1976(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(0)
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2006(2)
参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(2)
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参考文献(0)
二级参考文献(3)
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二级参考文献(3)
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RNA测序
GO分析
KEGG分析
Cpeb3
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华急诊医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1671-0282
CN:
11-4656/R
开本:
大16开
出版地:
杭州市解放路88号
邮发代号:
32-41
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
8511
总下载数(次)
24
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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中华急诊医学杂志1996
中华急诊医学杂志1995
中华急诊医学杂志1994
中华急诊医学杂志1993
中华急诊医学杂志1992
中华急诊医学杂志2020年第9期
中华急诊医学杂志2020年第8期
中华急诊医学杂志2020年第7期
中华急诊医学杂志2020年第6期
中华急诊医学杂志2020年第5期
中华急诊医学杂志2020年第4期
中华急诊医学杂志2020年第3期
中华急诊医学杂志2020年第2期
中华急诊医学杂志2020年第12期
中华急诊医学杂志2020年第11期
中华急诊医学杂志2020年第10期
中华急诊医学杂志2020年第1期
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