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摘要:
目的 分析小鼠肾缺血-再灌注损伤环状RNA(circRNA)及Hippo信号分子YAP的表达变化,初步探讨circRNA对肾缺血-再灌注损伤的作用.方法 构建小鼠肾缺血-再灌注损伤模型,检测血清肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)及肾组织病理改变判断模型成功.应用Illumina HiSeq2500系统进行高通量双端测序建立显著差异表达circRNA表达谱.实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证测序结果及检测相关基因.采用基因功能(GO)分析、通路(KEGG)分析等方法探讨差异表达circRNA参与肾IR损伤的生物功能及作用的主要信号通路.采用蛋白印迹实验检测主要信号分子的表达情况.结果 缺血组和对照组间差异显著的circRNA 21个(P<0.05,FC>2),其中10个表达上调,11个表达下调.随机(随机数字法)选取circRNA.1100和cⅡrcRNA.1122进行验证,结果显示肾IR 1d二者的相对表达倍数分别为(0.23±0.016)和(0.36±0.12),相比于对照组均显著降低(P<0.05),与测序数据趋势一致.circRNA.1100在IR2d和3d的肾组织中表达依然显著下调,相对表达倍数分别为(0.24±0.08)和(0.34±0.03)(P<0.05).circRNA.11 00母基因Cpeb3在肾IR1d、2d及3d的相对表达倍数分别为(0.047±0.022)、(0.098±0.027)和(0.185±0.055),与对照组比较显著下调.生物学功能和通路分析显示差异表达circRNA显著富集在细胞周期、分裂、生长、凋亡、死亡等生物过程及Hippo信号通路.肾IR1d后Hippo通路效应分子YAP蛋白明显上调,持续至IR第3天.结论 circRNA参与了肾IR损伤的生理病理过程,差异表达的circRNA及Hippo信号通路可能在肾IR损伤的发生发展中起关键作用.
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关键词云
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文献信息
篇名 肾缺血-再灌注损伤circRNA表达的变化及对Hippo信号途径的影响
来源期刊 中华急诊医学杂志 学科
关键词 环状RNA Hippo通路 YAP 肾缺血-再灌注损伤 RNA测序 GO分析 KEGG分析 Cpeb3
年,卷(期) 2020,(8) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 1066-1071
页数 6页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2020.08.012
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李勇 南昌大学第一附属医院肿瘤科 148 503 10.0 14.0
2 娄远蕾 南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所 47 114 7.0 8.0
3 刘芬 南昌大学第一附属医院重症医学科 61 327 11.0 14.0
4 邓君 南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所 16 24 3.0 4.0
5 罗丹 南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所 32 107 6.0 9.0
6 杨阳 南昌大学附属口腔医院检验科 28 56 4.0 6.0
7 张恒 南昌大学第一附属医院泌尿外科研究所 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
环状RNA
Hippo通路
YAP
肾缺血-再灌注损伤
RNA测序
GO分析
KEGG分析
Cpeb3
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华急诊医学杂志
月刊
1671-0282
11-4656/R
大16开
杭州市解放路88号
32-41
1994
chi
出版文献量(篇)
8511
总下载数(次)
24
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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