基于转录组测序的EV71感染RD细胞的基因表达变化研究

• 作者: 张晓延 张鑫艳 曹丽 程凯 郝晋芳
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 肠道病毒A型,人 转录组 基因表达 自噬 横纹肌肉瘤细胞 免疫应答
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 细胞与分子生物学
• 页码范围: 689-694
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2|R349.64
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/20193350

摘要

目的 基于转录组测序技术探讨肠道病毒71型(EV71)感染对人横纹肌肉瘤(RD)细胞自噬和免疫的影响及其作用机制.方法 用不同剂量EV71感染RD细胞确定感染复数(MOI).在MOI=1时选择不同时间点(0、0.5、1、1.5、3、6、9和12 h)共8组进行后续实验.倒置显微镜观察细胞形态和数量变化;蛋白免疫印迹(Western blot)检测蛋白表达情况;运用转录组测序技术分析细胞功能及基因表达的变化;高内涵细胞成像技术观察细胞内蛋白表达情况.结果 倒置显微镜可见细胞在病毒感染3h由梭形贴壁逐渐变为圆形悬浮,细胞数量相比0h明显减少(P<0.05).Western blot结果 显示细胞在感染后6 h、9 h、12 h,病毒在RD细胞内已经表达病毒衣壳蛋白1(VP-1),感染后9 h自噬相关蛋白LC-3Ⅱ/LC-3Ⅰ与0 h组相比明显升高(P<0.01).转录组测序结果 显示EV71感染RD细胞后3 h细胞内基因表达变化达到峰值,上调基因1199个,下调基因126个.KEGG分析提示改变的信号通路分子大多与自噬和免疫相关.高内涵细胞成像显示细胞在感染后数量减少,细胞内自噬蛋白平均荧光强度增加(P<0.05).结论 EV71感染RD细胞通过自噬相关信号通路促进病毒在细胞内完成复制和组装.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程凯	山西医科大学汾阳学院医学检验系	12	31	3.0	4.0
2	张晓延	山西医科大学汾阳学院医学检验系	21	35	3.0	4.0
3	曹丽	山西医科大学汾阳学院医学检验系	4	2	1.0	1.0
4	张鑫艳	山西医科大学汾阳学院医学检验系	2	0	0.0	0.0
5	郝晋芳	山西医科大学汾阳学院医学检验系	1	0	0.0	0.0