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西安交通大学学报(医学版)期刊
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慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质组学分析
慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质组学分析
作者:
孙月
张静
梁晓玲
梁钧泽
高桂彬
黄上嘉
黄思博
黄盛玲
原文服务方:
西安交通大学学报(医学版)
糖尿病
动静脉内瘘
iTRAQ
生物信息学
摘要:
目的 运用蛋白质组学的方法分析伴与不伴有糖尿病的慢性肾脏病5期(chronic kidney disease 5,CKD5)患者动静脉内瘘吻合口处静脉血管的蛋白表达及信号网路的差异,探究糖尿病患者血管狭窄率高的致病机制.方法 从Proteomexchange数据库中选出伴有与不伴有糖尿病的慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质谱原始(RAW)文件.采用Proteome Discoverer对RAW文件重新搜库.通过生物信息学分析其差异表达蛋白.结果 通过文献检索及数据质量评估,对iTRAQ定量比较伴与不伴有糖尿病的CKD5患者蛋白质谱数据(PXD010883)进行重新挖掘研究.经重新搜库与差异表达蛋白分析,共筛选出120个差异蛋白,其中89个上调,31个下调.通过对差异蛋白进行GO富集分析、IPA分析及KEGG通路富集分析,发现伴糖尿病CKD5组患者的ATP/AMP明显降低,具体表现为氧化呼吸链活动减弱以及腺嘌呤核糖核苷酸合成增强;另外伴糖尿病CKD5组患者的肌肉系统进程明显降低,这影响着血管平滑肌的正常功能.进一步分析发现,ATP/AMP与肌肉系统进程呈负相关.结论 通过定量蛋白质组分析发现,伴糖尿病CKD5患者的ATP合成代谢减弱,AMP合成代谢增强,血管平滑肌的肌肉系统进程减弱,导致血管平滑肌功能失调.这可能是伴糖尿病CKD5患者内瘘失功的机制之一.
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文献信息
篇名
慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质组学分析
来源期刊
西安交通大学学报(医学版)
学科
关键词
糖尿病
动静脉内瘘
iTRAQ
生物信息学
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
874-880
页数
7页
分类号
R34
字数
语种
中文
DOI
10.7652/jdyxb202006012
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张静
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糖尿病
动静脉内瘘
iTRAQ
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西安交通大学学报(医学版)
主办单位:
西安交通大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-8259
CN:
61-1399/R
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1937-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
4401
总下载数(次)
0
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26571
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