8株分离自四川、贵州地区猪繁殖与呼吸综合征病毒毒株的全基因组特征分析

• 作者: 于吉锋 周泷 康润敏 张斌 张毅 李春 汤承 王红宁 谢波
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离鉴定 全基因组 缺失 重组
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1382-1390
• 页数: 9页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 4729字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.06.021

摘要

本研究旨在了解近年来我国四川、贵州地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子流行病学及遗传变异情况,对该地区2016-2018年间采集的8份PRRSV阳性样品进行病毒分离鉴定和全基因组测序,进一步使用RDP4和Simplot生物软件对全基因序列进行重组分析.结果 显示,8个PRRSV毒株全基组全长为15 010～15 321 nt,毒株间相似性为80.9％0～91.7％.NSP2氨基酸分析结果显示,4个毒株表现出与HP-PRRSV毒株一致的30 aa缺失,另外4株表现出与NADC30毒株一致的131 aa缺失.其中,GZgy17表现为“1+19+29 aa”新型缺失模式.ORF5氨基酸分析显示,3个毒株在33位点出现新型的1 aa缺失.遗传重组分析显示,8个毒株表现出PRRSV-2毒株6种不同谱系(Lineage)间的重组方式,分别如下:1)SCnj16:L8+L1;2)SCxyz17:L1+L5;3) SCya18:L1+L3;4)GZgy17:L8+L3;5)SCcd17和SCN17:L1+L8+L5;6)SCcd16和SCya17:L1 +L8+L3.本研究结果表明,我国四川、贵州地区不仅有多种谱系PRRSV毒株并存,其基因组还出现了复杂的遗传重组现象,具有上述复杂基因组的PRRSV毒株在我国的流行状况值得高度关注.