海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库的建立

• 作者: 丁毅伟 李艳君 赵强元 马聪
• 来源期刊: 解放军医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 海洋细菌 细菌鉴定数据库 病原菌 微生物
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 719-723
• 页数: 5页
• 分类号: R446.5
• 字数: 3245字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-5227.2020.07.016

摘要

目的 建立海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库,为海洋细菌引起各类感染的病原快速鉴定提供支持.方法 本中心课题组2006-2016年收集国内外6个海域158个采样点海洋细菌530株,分离培养后进行细菌16srDNA扩增测序,应用FlexControl软件收集蛋白谱图,Biotyper软件构建评价数据库.分别用仪器商品化数据库、自建数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,比较各数据库的鉴定差异.结果 自建本地化海洋细菌鉴定数据库包含32个菌属,82个菌种,共计421株海洋细菌谱图.以16srDNA测序鉴定结果 为金标准,验证菌株用商品化数据库鉴定时正确80株,鉴定正确率80.8％,用扩展数据库鉴定时正确97株,鉴定正确率98.0％,差异有统计学意义(P<0.001).结论 自建海洋细菌鉴定数据库菌株的鉴定能力较商品化数据库更强,有助于海洋细菌引起相关感染的诊断和治疗.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马聪	解放军总医院第六医学中心检验科	15	72	5.0	8.0
2	赵强元	解放军总医院第六医学中心检验科	5	3	1.0	1.0
3	李艳君	解放军总医院第六医学中心检验科	1	0	0.0	0.0
4	丁毅伟	解放军总医院第六医学中心检验科	2	5	1.0	2.0