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鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析
鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析
作者:
王卫民
王旭
王至诚
王超杰
罗毅
黎洁
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
皮特不动杆菌
全基因组测序
ANI分析
比较基因组学
毒力特征
摘要:
皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌,为了对该菌的致病机理进行研究并为该菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备,实验选取皮特不动杆菌菌株Ap-W20进行了全基因组测序,并对其毒力特征进行了分析.结果 发现,Ap-W20全基因组序列总长为4399705 bp,GC含量为38.78%,共预测到4230个编码序列(CDS),存在4个质粒,GenBank数据库登录号为CP027658~CP027662.ANI分析结果证实,Ap-W20属于皮特不动杆菌,且Ap-W20与已知人源皮特不动杆菌AP_882(96.69%)和环境源皮特不动杆菌PHEA-2(96.55%)相似度较高.Ap-W20与AP_882、PHEA-2的比较基因组学分析发现,Ap-W20中的基因岛、前噬菌体和质粒数量最多,这很可能与它们各自的分离环境和致病力有关.通过与毒力因子数据库(VFDB)比对,在Ap-W20全基因组中预测到286个毒力基因,主要与黏附和抗吞噬等有关.Ap-W20中还存在Ⅰ、Ⅱ和Ⅵ型分泌系统、多套双组分调控系统以及细菌素合成基因簇等,表明鱼源皮特不动杆菌可能存在复杂的致病机制.本研究对鱼源皮特不动杆菌全基因组进行了毒力特征分析,为该菌引起的鱼类疾病防治奠定了基础.
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文献信息
篇名
鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析
来源期刊
水产学报
学科
农学
关键词
皮特不动杆菌
全基因组测序
ANI分析
比较基因组学
毒力特征
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1488-1501
页数
14页
分类号
Q785|S941.42
字数
语种
中文
DOI
10.11964/jfc.20200212147
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单位
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水产学报
主办单位:
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-0615
CN:
31-1283/S
开本:
大16开
出版地:
上海市临港新城沪城环路999号
邮发代号:
4-297
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
3756
总下载数(次)
11
总被引数(次)
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