基于高通量测序的三七微生物群落结构特征分析

• 作者: 刘珍珍 叶晓婉 席宇 张臣 朱大恒 朱润琪 许妍妍 谷萌萌 陈辰 马明莉 马轩
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 鲜三七 干三七 多样性 功能菌群 Illumina MiSeq
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 204-209
• 页数: 6页
• 分类号: R282.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.01.027

摘要

目的 获得鲜三七和干三七菌群结构信息.方法 以鲜三七和干三七为研究材料,利用Illumina MiSeq平台,采用高通量测序并进行数据分析.结果 鲜三七和干三七共获得637个操作分类单元(OTUs),其中15个OTU为共有,鲜三七和干三七特有的OTU数量分别为484、123个.新鲜三七中占比较大的菌门为变形菌门(Proteobacteria,59.7％)、厚壁菌门(Firmicutes,40.1％);干三七中占比较高的菌门为厚壁菌门(Firmicutes,99.8％).鲜三七中占比较大的菌属为肠杆菌属(Enterobacter,37.4％)、嗜碱菌属(Alkaliphilus,11.5％);干三七中占比较大的菌属是芽孢杆菌属(Bacillus,54.6％),类芽孢杆菌(Paenibaciiius,44.9％).KEGG功能预测表明干三七的萜类化合物和聚酮类化合物代谢功能菌群的相对丰度高于鲜三七.结论 鲜三七菌群多样性高于干三七;干三七中的萜类化合物和聚酮类化合物代谢功能菌群丰富度高于鲜三七,这为三七发酵皂苷菌株筛选提供了重要参考.