里氏木霉与黏绿木霉中非核糖体肽合成酶的生物信息学分析

• 作者: 祝友朋 韩长志
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 里氏木霉 黏绿木霉 非核糖体肽合成酶(NRPS) 理化性质 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 1119-1125
• 页数: 7页
• 分类号: S435.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2020.05.007

摘要

为了更好地解析里氏木霉和黏绿木霉在次生代谢产物关键基因方面的差异,以非核糖体肽合成酶(NRPS)为例,通过antiSMASH预测网站对上述2种木霉开展次生代谢产物基因找寻.结果表明,里氏木霉中含有87个NRPS蛋白,而黏绿木霉中含有214个NRPS蛋白,后者明显高于前者;同时,利用ProtComp v9.0、PHD等生物信息学预测网站对上述木霉中NRPS蛋白进行亚细胞定位、理化性质以及二级结构等特征分析,明确2种木霉中NRPS蛋白具有以下共同特征:理论等电点多集中在5.01至7.00之间,不稳定性系数多集中在30.01至50.00之间,高达75％以上的蛋白质属于亲水性蛋白质,而二级结构组成特征则以 α 螺旋为主,转运肽情况尚未明确,保守结构域较多,亚细胞定位多集中在线粒体等.