波罗蜜叶绿素缺失突变体嫩茎转录组分析

• 作者: 于旭东 吴繁花 曹佩娜 罗佳佳 董俊娜 蔡泽坪 郑李婷
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 波罗蜜 叶绿素缺失突变体 嫩茎 转录组分析
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 组学与生物技术
• 页码范围: 1513-1521
• 页数: 9页
• 分类号: S718.43
• 字数: 5073字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.08.002

摘要

为探究叶绿素合成缺失对波罗蜜嫩茎发育的影响,以波罗蜜叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant,CDM)嫩茎为材料进行转录组分析;经de novo组装后获得295869个Unigenes,使用NR、NT、Swissprot、KEGG、KOG、Pfam和GO数据库进行序列比对,共注释了174291个Unigenes.过滤低丰度基因后,筛选出22988个差异基因.与对照(CK)相比,CDM中上调基因有379个,下调基因有22609个.GO分类结果表明,共有3712个基因获得注释,并将其划分为分子功能(molecular function)、细胞组分(cellular component)和生物学过程(biological process)三大类,共48个功能组;此外,有2080个Unigenes参与到19条KEGG通路上,其中在黄酮类生物合成途径中有30个Unigenes.该研究通过转录组测序,分析叶绿素合成缺失对波罗蜜嫩茎发育的影响,为木本植物茎发育的研究提供数据基础.