桑树桑黄菌丝体和子实体基因差异表达分析

• 作者: 周祖法 宋吉玲 王伟科 袁卫东 闫静 陆娜
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 桑黄 菌丝体 子实体 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1874-1885
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.200078

摘要

通过对桑树桑黄Sanghuangporus sanghuang菌丝体和子实体2个不同生长阶段的转录组进行分析,为研究桑黄子实体生长发育相关机制奠定基础.采用Illumina测序技术,对桑树桑黄菌株S23菌丝体和子实体2个不同生长发育阶段进行了全转录组测序.将转录组测序reads比对到参考序列上,菌丝体测序样本的reads比对率为82.89％;子实体测序样本的reads比对率为83％.基因差异表达分析显示,与菌丝体相比,子实体中显著上调表达基因为2 898个,显著下调表达基因为1 965个.经过Blast nr比对发现,桑黄菌在子实体阶段表达量上升的基因主要与各种氧化酶活性、疏水蛋白等相关;表达量下降的基因主要与糖类、氨基酸结合、运输等相关.基因本体(gene ontology,GO)富集分析表明,菌丝体及子实体两个阶段与跨膜转运相关的差异表达基因富集明显.代谢通路(pathway)富集分析表明,类固醇生物合成、精氨酸生物合成、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路等差异基因富集明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫静		59	82	5.0	6.0
2	周祖法		53	75	5.0	6.0
3	袁卫东		66	85	5.0	6.0
4	王伟科		65	134	7.0	9.0
5	陆娜		60	77	5.0	6.0
6	宋吉玲		46	64	4.0	5.0