7-lncRNA风险评估模型在胰腺癌预后判断中的价值

• 作者: 史爽 孙丽 徐康红 李娟 李小萌 杜鲁涛 江新泉 王楠 王雪 辛永红
• 来源期刊: 中国现代普通外科进展
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺癌 长链非编码RNA 预后 TCGA
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 337-343
• 页数: 7页
• 分类号: R735.9
• 字数: 4051字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9905.2020.05.001

摘要

目的:筛选胰腺癌预后相关长链非编码RNA(lncRNA),构建预后风险评估模型.方法:下载TCGA数据库中胰腺癌数据,使用R语言分析差异表达的lncRNA分子.通过单因素Cox回归和Lasso回归分析胰腺癌预后相关lncRNA分子,采用多因素Cox回归构建预后风险评估模型,并应用Ka-plan-Meier(K-M)生存分析、受试者操作特征(ROC)曲线进行效能评价.结果:以|log2 Fold Change|>2,错误发现率(FDR)<0.05为筛选标准,发现179个lncRNA分子在胰腺癌中呈差异表达,对其中高表达的117个lncRNA进行单因素Cox回归与Lasso回归分析,得到7个与预后相关的lncRNA.通过多因素Cox回归建立预后风险评分模型,风险评分=1.4231×AL161431.1+1.3457×ANLN+1.4731×FAM83A+1.4721×LAMA3+1.2198×LY6D+×1.1515×MYEOV+1.1825×TINAG.K-M分析显示高风险组的总生存时间较短,训练集、验证集和总体数据集ROC曲线显示3年生存率的曲线下面积分别为0.859、0.878和0.886.结论:通过生物信息学分析,成功构建了包括AL161431.1、ANLN、FAM83A、LAMA3、LY6D、MYEOV和TINAG的胰腺癌7-lncRNA预后模型,能够对患者生存状态进行有效预测.