黄瓜果瘤位置性状遗传与QTL分析

• 作者: 孙成振 宋晓飞 李晓丽 郭晓雨 闫立英
• 来源期刊: 中国瓜菜
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 果瘤位置 BSA-seq QTL定位
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 12-17
• 页数: 6页
• 分类号: S642.2
• 语种: 中文

摘要

黄瓜为重要的蔬菜作物,解析黄瓜果瘤位置性状遗传规律与QTL定位,对深入研究果瘤位置形成分子机制和新品种选育有重要意义.以果瘤上移自交系X1(P1)和果瘤下移自交系X2(P2)为亲本构建F2群体,进行表型鉴定,解析遗传规律.分别选取20株果瘤上移和20株果瘤下移极端表型植株,构建果瘤上移池(Tu)、果瘤下移池(Td)和亲本池(Mp、Pp)并进行高通量测序(BSA-seq).结合生物信息学分析,预测与黄瓜瓜把果瘤位置相关的QTL.根据黄瓜果瘤位置表型数据分析,P1平均值均为负值,为果瘤上移,P2平均值均为正值,为果瘤下移;F1倾向于母本,F1反倾向于父本,F2在5.22～6.14间为高亲值(接近父本),在0.23～2.32间为低亲值(接近母本),黄瓜果瘤位置表现为数量性状,F2更趋向于果瘤下移.预测到的候选基因主要与细胞的新陈代谢(CsaV3_1G009410、CsaV3_1G012820、CsaV3_1G028340)、信号转导(CsaV3_1G012480、CsaV3_4G029960、CsaV3_1G030640、CsaV3_1G029520、CsaV3_1G004360)、结构蛋白(CsaV3_1G030620、CsaV3_5G004870、CsaV3_1G031140),以及细胞激酶(CsaV3_1G033300、CsaV3_4G034190)和植物激素(CsaV3_5G015510)有关.根据△All-index在染色体上的分布推断位于1号染色体(5.840～18.376 Mbp)的CsaV3_1G030610、CsaV3_1G029520和CsaV3_1G030640为主要候选基因.CsaV3_1G030610中的阿魏酸与细胞壁形成有关;CsaV3_1G029520中的拟南芥SMAX1家族基因,作为KAR/SL信号分子调控种子萌发、根毛的形成与伸长;CsaV3_1G030640编码与ARIA相互作用的ap2结构域蛋白ADAP,正调控ABA信号,进而影响生长发育.因此推测果瘤位置的形成与细胞壁相关基因及信号转导有关.推测定位于黄瓜1号染色体重叠区域(5.840～18.376 Mbp)的候选基因CsaV3_1G030610主要参与细胞壁形成,与果瘤有关联,推测其与黄瓜果瘤位置性状有关系,但还需进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫立英		34	146	6.0	11.0
2	李晓丽		27	78	6.0	8.0
3	宋晓飞		18	49	4.0	6.0
4	孙成振		24	24	3.0	3.0
5	郭晓雨		3	0	0.0	0.0