1株类NADC30与类JXA1重组的猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传特征分析

• 作者: 乔松林 张改平 耿瑞 邓瑞广 郭振华 阮海宇 陈鑫鑫
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 同源性分析 系统进化树 遗传变异 基因重组
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1677-1687
• 页数: 11页
• 分类号: S852.659.6|S855.3
• 字数: 5723字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.07.020

摘要

旨在分析本实验室2017年从临床病料中分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分子遗传特征,测定了其全基因组序列,并运用生物信息学软件对其遗传特点进行了分析.结果显示,该毒株基因组全长15054 bp,与代表性毒株VR-2332、NADC30、CH-1a、JXA1和QYYZ的核苷酸相似性分别为84.5％ 、93.4％ 、84.2％ 、83.9％ 和82.1％.系统进化树分析显示,该毒株与NADC30-like毒株处于同一进化分支,属于lineage 1.基于GP5和Nsp2蛋白的氨基酸序列分析显示,分离株GP5蛋白糖基化位点位于34位、44位和51位;在37—45 aa的线性表位区较为保守,在27—30 aa和37—45 aa的线性表位区存在特异的氨基酸位点变异;Nsp2蛋白存在NADC30-lke毒株特征性的131个(323—433位、483位、504—522位)不连续氨基酸的缺失.基因重组分析显示,该毒株以类NADC30为主要亲本、以类JXA1为次要亲本,在Nsp2的氨基端(1340—2082 nt)发生了基因重组.本研究成功绘制了1株NADC30-like毒株的基因组遗传特征,确定了其在Nsp2区域发生了基因重组,提示PRRSV通过基因重组在不断发生遗传演化,开展持续的PRRSV流行及遗传变异监测对于该病的防控具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张改平		103	840	15.0	24.0
2	邓瑞广	河南省农业科学院动物免疫学重点实验室农业部动物免疫学重点实验室	63	543	11.0	20.0
3	乔松林	河南省农业科学院动物免疫学重点实验室农业部动物免疫学重点实验室	32	92	5.0	8.0
4	陈鑫鑫	河南省农业科学院动物免疫学重点实验室农业部动物免疫学重点实验室	5	24	3.0	4.0
5	郭振华	河南省农业科学院动物免疫学重点实验室农业部动物免疫学重点实验室	17	40	3.0	6.0
6	阮海宇		5	1	1.0	1.0
7	耿瑞		1	0	0.0	0.0