环状RNA在小鼠肺发育中的连续表达及功能预测

• 作者: 付雪 周晓光 周晓玉 杨洋 沈艳青
• 来源期刊: 中国当代儿科杂志
• 关键词: 肺发育 环状RNA 生物信息学分析 小鼠
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 论著·实验研究
• 页码范围: 1125-1130
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7499/j.issn.1008-8830.2004071

摘要

目的 探讨环状RNA(circRNA)circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359在小鼠肺发育中的连续表达及潜在功能.方法 根据肺发育分期,取孕16.5 d(E16.5 d)、孕18.5 d(E18.5 d)及生后2 d(P2 d)胎鼠及新生小鼠的肺组织,利用苏木精-伊红染色观察肺组织形态学;利用qRT-PCR技术检测晚期肺发育过程中circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359的表达情况;应用miRanda和TargetScan软件预测circRNA的靶向miRNA,然后对靶基因进行GO和KEGG分析并预测相应circRNA功能.结果 在E16.5 d小鼠肺组织切片中观察到Ⅱ型肺泡上皮细胞,且逐渐增多,P2 d时肺泡迅速扩张,间质变薄,肺泡结构逐渐成熟;qRT-PCR结果显示circ4:150439343|150477468相对表达量随时间推移持续上调(P<0.05),circ15:73330849|73343359的相对表达量先下调再上调(P<0.05);宿主基因功能预测显示circRNA可参与Notch、PI3K-Akt和NF-κB等信号通路.结论 circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359可通过Notch等信号通路参与肺发育的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周晓玉	南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心	100	606	14.0	20.0
2	杨洋	南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心	21	69	6.0	7.0
3	周晓光	南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心	28	95	6.0	8.0
4	付雪	南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心	1	0	0.0	0.0
5	沈艳青	南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心	2	0	0.0	0.0