miR-22-3p在鼻咽癌中的表达及靶基因功能分析

• 作者: 吕艳茹 尹梦婕 徐志勇 曹宇华 沈婧怡 莫华清 蒿艳蓉 袁贤彬 谢嫣嫣 高珊
• 来源期刊: 医学研究生学报
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 miR-22-3p 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1127-1133
• 页数: 7页
• 分类号: R739.62
• 语种: 中文
• DOI: 10.16571/j.cnki.1008-8199.2020.11.002

摘要

目的 目前关于鼻咽癌中miR-22-3p的表达情况和作用机制尚不明确.文中旨在研究miR-22-3p在鼻咽癌中的表达情况,分析其表达对鼻咽癌发生发展的影响.方法 从GEO数据库中下载鼻咽癌组织miRNA表达数据GSE36682,分析miR-22-3p在鼻咽癌组织中的表达变化,应用qRT-PCR在鼻咽癌细胞中进一步验证.根据慢病毒转染分为:过表达组(转染miR-22-3p过表达慢病毒)、阴性对照组(空载病毒)、空白组(不转染).应用生物信息学软件及数据集GSE53819中预测并筛选表达有差异的靶基因,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,同时构建靶基因的蛋白互作网络并找出其关键基因,探究miR-22-3p表达失调在鼻咽癌中发生发展过程中的作用.结果 鼻咽癌中miR-22-3p呈明显低表达(P<0.01).ROC曲线表明在鼻咽癌中miR-22-3p的表达具有一定诊断效能(AUC:0.984,95％CI:0.970～0.998).过表达组WNT5A相对表达量(0.423±0.079)明显低于空白组(1.000±0.000)、阴性对照组(0.915±0.237),差异有统计学意义(P<0.05);CXCL5亦明显降低(P<0.05).在生物信息学软件及数据集中预测并筛选后得到201个差异表达的miR-22-3p的靶基因,GO功能分析表明miR-22-3p靶基因产物主要涉及对无机及有机物质的反应、Wnt受体信号通路等生物学过程,还包括跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白域特异性结合等分子功能,KEGG通路富集分析表明这些靶基因主要参与趋化因子信号通路、癌症通路.此外,WNT5A、GNG7、CXCR5、CCR7、CXCL5、TFRC、STAT1、CX3CR1、KIAA0319为筛选出的miR-22-3p的关键靶基因,其中WNT5A、CXCL5、TFRC、STAT1呈现表达上调,CXCR5、GNG7、CCR7、CX3CR1、KIAA0319呈现表达下降(P<0.01).预后分析发现GNG7、CXCR5、CCR7、CX3CR1低表达及TFRC的高表达与头颈部鳞癌的不良预后具有明显的相关性(P<0.01).结论 miR-22-3p在鼻咽癌中表达下调,可能通过调控其靶基因WNT5A、CXCL5等在鼻咽癌中发挥重要作用.