温度胁迫对幼体大海马基因转录表达的影响

• 作者: 宁燕 徐永健 沈锡权 潘霞
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 大海马 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1421-1431
• 页数: 11页
• 字数: 7658字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2020.07.1421

摘要

为探究大海马幼体在高温和低温胁迫条件下基因表达水平的变化规律,采用Illumina平台的PE150测序功能对大海马幼体肝脏进行了转录组测序.对照组、高温胁迫组和低温胁迫组测序数据组装后获得22 513个单基因簇(Unigene),N50为2 223 bp,平均长度为1 122.71 bp.与对照组相比,高温胁迫组共获得14 009个差异表达基因,其中5 543个差异表达基因上调,8 466个差异表达基因下调;低温胁迫组共获得20 030个差异基因,14 016个差异表达基因上调,6 014个差异表达基因下调.差异表达基因经KEGG数据库富集发现,高/低温胁迫均导致大海马体内抗氧化途径相关基因表达(HSP70、HSP90、SOD等)发生显著改变;另外,高温胁迫还造成大海马免疫系统相关基因(PIK3R、Akt、IL-10、TLR等)以及细胞凋亡相关基因(CYCS、CASP9、CASP3等)表达显著改变;低温胁迫造成DNA损伤修复(MSH、DDB2、XRCC2、RAD52、Ogg1、PMS2等)、脂肪酸代谢(StARD7、ApoA4、CYP51、Fadsd6等)和细胞凋亡(P21、P53、BAX等)相关基因显著上调.选择HSP70、Fadsd 6与IL-10等13个差异基因验证,RT-qPCR结果与RNA-Seq测序结果基本一致.本研究结果为深入探究大海马温度应激的调控机制奠定了一定的理论基础,而且有助于预防极端温度对大海马造成损伤.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈锡权	宁波大学海洋学院	23	276	10.0	16.0
2	徐永健	宁波大学海洋学院	61	541	13.0	21.0
3	潘霞	宁波大学海洋学院	4	2	1.0	1.0
4	宁燕	宁波大学海洋学院	3	0	0.0	0.0