胡葱黄条病毒吉林毛葱分离物全基因组序列测定与分析

• 作者: 张宸 张春雨 李小宇 王永志 马俊丰
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 胡葱黄条病毒 分蘖洋葱(毛葱) 全基因组 变异分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 44-48
• 页数: 5页
• 字数: 3164字
• 语种: 中文

摘要

使用RT-PCR方法从吉林省疑似感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的分蘖洋葱(毛葱)叶片中获得了SYSV吉林毛葱分离物SYSV-JL(MN607702)的全基因组序列.SYSV-JL的全长序列为10427 nt,与GenBank已登录的3条SYSV全长或近全长序列在多个基因上保持着较高的序列一致性,但在P1基因上核苷酸和氨基酸序列一致性较低,分别为69.5％～84.2％和60.9％～76.9％,进一步通过变异分析发现,P1基因包含369个变异位点,表现出较为明显的高变异特征.系统发育分析显示,不同SYSV分离物具有较为明显的地区差异,SYSV-JL分离物与多个中国分离物系统发育关系较近.