基于转录组学的养殖密度影响斑节对虾品质的分子机制

• 作者: 李玲 周伟 李璐 王洋 孙学亮 梁丽雅 马俪珍
• 来源期刊: 肉类研究
• 学科: 工学
• 关键词: 斑节对虾 养殖密度 肌肉品质 转录组 分子机制
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: TS254.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/rlyj1001-8123-20200924-233

摘要

采用高通量转录组测序和实时定量聚合酶链式反应(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术,在分子水平揭示养殖密度对斑节对虾肌肉品质形成的影响机制.选取养殖密度100尾/m2、300尾/m2的斑节对虾为实验材料,进行转录组测序和qRT-PCR验证.结果 表明:所有样本Q20和Q30的最小值均大于90％,测序数据均满足生物信息学分析的要求;不同密度养殖条件下,斑节对虾的差异表达基因为778个;将差异基因序列与7个数据库进行比对,得到不同密度养殖的斑节对虾中与肌肉品质相关的差异基因分布在胶原蛋白代谢、蛋白水解、蛋白转运、细胞蛋白代谢、细胞骨架组织、肌肉连接及葡萄糖代谢途径;qRT-PCR验证结果与转录组测序结果一致.