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基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究
基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究
作者:
唐秀松
尚昱志
庞宇舟
张青槐
方刚
陈秋霞
韦露秋
黄安
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
反向分子对接
网络药理学
生物信息学
青藤碱
类风湿关节炎
作用机制
摘要:
目的:通过分子反向对接和网络药理学预测青藤碱(SN)治疗类风湿关节炎(RA)的潜在靶点、通路,探究SN治疗RA的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)评估SN的可药性,将药物再定位及药物不良反应预测服务器(DRAR-CPI)预测出的SN潜在靶点与DisGeNET数据库中查询到的RA靶点作交集,以获取SN治疗RA的潜在靶点,利用GeneMANIA构建靶点间相互关系网络及筛选hub靶点,利用KOBAS 3.0和Omicshare平台工具等进行基因本体(GO)、京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:SN的理化性质表明其具有良好的可药性.预测出SN治疗RA的潜在靶点47个,相关潜在靶点间存在共表达特征、可预测到的相互作用关系等关联,并筛选出蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、硫氧还蛋白(TXN)3个hub靶点.GO富集结果涉及16个生物学过程、7个分子功能及10个细胞组件,KEGG显著富集通路的前10条通路包括细胞凋亡通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、Ras相关蛋白1(Rap1)信号通路等.结论:SN可能通过作用于AKT1、TP53、TXN、白细胞介素-10(IL-10)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等靶点及细胞凋亡、TNF信号通路、HIF-1信号通路、相关蛋白Rap1信号通路等通路影响RA的疾病过程,为后期相关实验验证及临床应用研究提供了数据支撑.
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文献信息
篇名
基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究
来源期刊
中国现代中药
学科
医学
关键词
反向分子对接
网络药理学
生物信息学
青藤碱
类风湿关节炎
作用机制
年,卷(期)
2020,(10)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
1668-1674
页数
7页
分类号
R285.5
字数
语种
中文
DOI
10.13313/j.issn.1673-4890.20191029004
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
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1
庞宇舟
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方刚
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3
张青槐
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黄安
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尚昱志
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韦露秋
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陈秋霞
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生物信息学
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类风湿关节炎
作用机制
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期刊影响力
中国现代中药
主办单位:
中国中药协会
中国医药集团有限公司
中国中药有限公司
出版周期:
月刊
ISSN:
1673-4890
CN:
11-5442/R
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区西四环北路15号依斯特大厦8层
邮发代号:
82-302
创刊时间:
1999
语种:
chi
出版文献量(篇)
6500
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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