基于富集分析的乳腺癌发病相关通路探讨

• 作者: 李继媛 杨晓蕾 王琪 葛杰 谢志平 贾月辉 郑毅 韩云峰
• 来源期刊: 系统医学
• 学科: 医学
• 关键词: 富集分析 乳腺癌 通路分析
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 基础医学系统研究
• 页码范围: 29-33
• 页数: 5页
• 分类号: R36
• 字数: 3396字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19368/j.cnki.2096-1782.2020.11.029

摘要

目的 从通路水平探讨乳腺癌发病的相关基因.方法 使用i-GSEA4GWASv2和ICSNPathway对GRASPv2.0中乳腺癌的GWAS数据进行基因富集分析,有意义的GO通路依照GO数据库注释构建有向无环图.结果 与乳腺癌发生有关的4条通路:小GTP酶介导的信号转导(P平均=0.002;FDR平均=0.017)、GnRH信号通路(P平均=0.005;FDR平均=0.041)、MAPK信号通路(P平均=0.001;FDR平均=0.026)、长时程增强通路(P平均=0.002;FDR平均=0.025).结论 为乳腺癌发病机制从小GTP酶信号转导、刺激信号传递、性腺激素释放激素方面提供了新的思路.