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摘要:
为研究不同体况对妊娠初期母牛阴道菌群的影响,采集相同放牧条件下不同体况妊娠初期西门塔尔母牛18头(每组6头,偏瘦组(TC),标准组(MC)和肥胖组(FC))阴道分泌物,利用16S rRNA测序技术对其阴道菌群多样性进行分析.结果 显示:18份样品平均每份样品测得70 567条序列,经过质控平均得到68 309条序列,质控有效率达96.84%;通过聚类共获得2 677个操作分类单元(Operational taxonomic units,OTU),37.58%的OTU注释到门水平,24.36%的OTU注释到属水平;标准组阴道菌群Alpha多样性指数的Shannon指数、Chao1指数和ACE指数均显著低于肥胖组和偏瘦组(P<0.05);各组阴道菌群的Good's coverage指数均在99.4%以上,表明样本测序质量较高;在门水平上,偏瘦组、标准组和肥胖组妊娠初期母牛阴道中前10大优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、无壁菌门(Tenericutes)、放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、未知菌门(Unidentified_Bacteria)、螺旋体菌门(Spirochaetes)和Melainabacteria;在属水平上,偏瘦组、标准组和肥胖组前10大优势菌属分别为拟杆菌属(Bacteroides)、阿利斯佩斯菌属(Alistipes)、气球菌属(Aerococcus)、费氏菌属(Faecalibacterium)、链杆菌属(Streptobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、嗜组织菌属(Histophilus)、脲原体菌属(Urea plasma)和支原体属(Mycoplasma),其中标准组嗜组织菌属显著高于其他2组(P<0.05).
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文献信息
篇名 不同体况对妊娠初期母牛阴道菌群的影响
来源期刊 中国农业大学学报 学科 农学
关键词 妊娠母牛 不同体况 阴道菌群 多样性
年,卷(期) 2020,(12) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 49-57
页数 9页 分类号 S823.9+2
字数 语种 中文
DOI 10.11841/j.issn.1007-4333.2020.12.06
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 敖日格乐 116 468 12.0 16.0
2 斯木吉德 33 153 7.0 11.0
3 王纯洁 125 534 12.0 17.0
4 刘波 12 32 4.0 5.0
5 张晨 7 4 1.0 2.0
6 陈浩 10 13 2.0 3.0
7 阿日查 9 9 2.0 3.0
8 张剑 9 3 1.0 1.0
9 何利娜 1 0 0.0 0.0
10 崔银雪 2 0 0.0 0.0
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阴道菌群
多样性
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中国农业大学学报
月刊
1007-4333
11-3837/S
大16开
北京海淀区圆明园路2号
1955
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