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应用高通量测序技术检测甲状腺乳头状癌相关基因变异
应用高通量测序技术检测甲状腺乳头状癌相关基因变异
作者:
杨德仁
王卓
马蓉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
高通量测序技术
基因突变
甲状腺乳头状癌
摘要:
目的 探讨高通量测序技术(next generation sequencing,NGS)在甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)相关的15个靶基因变异检测中的应用价值.方法 收集2019年1月至2020年6月就诊的188例PTC患者手术切除的癌组织石蜡包埋标本,采用NGS技术检测其中15个目标基因;利用GATK 4.0.2.0、VarScan.v2.3.9和Factera 1.4.4软件分析基因变异的特点.结果 共计80.32%(151/188)的标本检出突变.其中74.47%(140/188)的标本检出1个点突变或基因融合突变,5.32%(10/188)的标本同时检出2个点突变,0.53%(1/188)的标本同时检出3个点突变.151例突变标本中共检出点突变及基因融合突变163个,其中BRAF基因检出率最高.在所有双突变的标本中,2个不同突变等位基因突变丰度基本一致.在3个基因同时发生突变的标本中,TERT和NRAS基因等位基因突变丰度基本一致,而TP53基因等位基因突变丰度显著低于其他2个基因.PTC患者基因突变与性别(χ2=0.585,P>0.05)、年龄(χ2=0.575,P>0.05)及临床分期(χ2=0.711,P>0.05)均无关.结论 NGS技术检测PTC相关基因突变位点具有经济、效率高和可定量的优势,可为患者的诊断、预后和个体化治疗提供依据.
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应用高通量测序技术检测甲状腺乳头状癌相关基因变异
来源期刊
临床检验杂志
学科
医学
关键词
高通量测序技术
基因突变
甲状腺乳头状癌
年,卷(期)
2020,(12)
所属期刊栏目
临床检验技术研究
研究方向
页码范围
891-893,913
页数
4页
分类号
R446.9
字数
语种
中文
DOI
10.13602/j.cnki.jcls.2020.12.03
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高通量测序技术
基因突变
甲状腺乳头状癌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床检验杂志
主办单位:
江苏省医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-764X
CN:
32-1204/R
开本:
大16开
出版地:
南京市中央路42号
邮发代号:
28-104
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
5950
总下载数(次)
22
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