田间自然温度调控下核桃根系差异表达基因分析

• 作者: 刘洋 卞少杰 卢凯政 张雪梅 郭素萍 齐国辉
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 核桃 根系 自然温度调控 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（17）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 30-38
• 页数: 9页
• 分类号: S792.132
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20194278

摘要

以十五年生'绿岭'核桃树为试材,采用高通量转录组测序的方法,研究了不同地温(地温16.4℃,W0;地温21.7℃,W1;地温27.1℃,W2)对核桃根系基因表达量的影响,以期挖掘与温度调控相关的功能基因,探明自然温度调控下核桃根系的应答反应的分子机制.结果 表明:W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1显著上调基因分别为430、2 110、2 385个,显著下调基因分别为247、2 494、3 015个.GO富集分析表明,W1 vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差异表达基因均主要富集在生物学过程和分子功能两大类别,共同显著富集的GO类别有氨基糖分解代谢过程、单体生物合成过程、几丁质分解过程、含氨基葡萄糖化合物分解代谢过程、氧化还原过程和氧化还原酶活性;但W1 vsW0的差异基因显著富集的分子功能多与物质的合成代谢相关,而W2vsW1的差异基因显著富集的分子功能多与转录因子相关.KEGG富集分析表明,W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差异表达基因分别被注释到74、118、117条KEGG代谢通路,共同被注释到的有71条,其中显著富集的通路有次生代谢产物的生物合成和苯丙烷生物合成等;与W1vsW0相比,W2vsW1的差异基因显著富集的KEGG代谢通路增加了a-亚麻酸代谢通路.温度升高可促进植物的新陈代谢,有助于碳水化合物的积累,但过高的温度会降低水分的运输速率,a-亚麻酸代谢相关基因大量表达,表明α-亚麻酸可能在核桃根系应对高温胁迫中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭素萍	河北农业大学林学院	80	702	14.0	21.0
2	卞少杰	河北农业大学林学院	1	0	0.0	0.0